乳酸桿菌(LB)核酸檢測(cè)試劑盒(PCR-熒光探針法)
規(guī)格：50次
價(jià)格：5860元
產(chǎn)品及特點(diǎn)
乳酸桿菌是可使葡萄糖等糖類分解為乳酸的各種細(xì)的總稱。乳酸菌是一種無芽孢 的桿菌，屬革蘭氏陽性菌，厭氧性呼吸。廣泛分布于自然界，有些菌株是人和動(dòng)物口 腔、腸道及道的正常菌群之一，很少致病，除極偶爾引起亞急性細(xì)性心內(nèi)膜炎外， 對(duì)人基本無害。寄生于口腔的乳酸桿菌在齲齒發(fā)生中起重要作用。一般認(rèn)為寄生于腸 道和道的乳酸桿菌對(duì)機(jī)體有保護(hù)作用某些乳桿菌如嗜酸性乳桿菌、保加利亞乳桿菌， 常用于飲料的發(fā)酵工業(yè)。本公司開發(fā)乳酸桿菌屬通用染料法熒光定量 PCR 試劑盒，它 具有下列特點(diǎn)： 1. 即開即用，用戶只需要提供 DNA 模板。 2. 引物根據(jù)乳酸桿菌屬專一區(qū)設(shè)計(jì)，特異性高。 3. 熒光定量 PCR 檢測(cè)，比常規(guī) PCR 更加靈敏。 4. 一管式閉管操作，降低了交叉污染。 5. 本試劑盒足夠 50 次 20μL 反應(yīng)體系的熒光定量 PCR。 6. 本產(chǎn)品只適用于科研，不能用于臨床診斷。
乳酸桿菌屬通用染料法熒光定量PCR試劑盒規(guī)格及成分
|
成分 |
編號(hào) |
十孔盒包裝 |
|
2×qPCR MagicMix |
A |
500μL（棕色管） |
|
熒光 PCR 專用模板稀釋液 |
|
1 mL（黃蓋） |
|
乳酸桿菌屬通用PCR 引物混合物 |
C |
100μL（白蓋） |
|
乳酸桿菌屬通用 PCR 陽性對(duì)照(1×10E8 拷貝/μL) |
D |
50μL（紅蓋） |
|
DNA 病毒裂解液（試用裝） |
E |
15 次（9 mL） |
|
使用手冊(cè) |
F |
1 份 |
運(yùn)輸及保存： 低溫運(yùn)輸，-20℃保存，有效期一年。
自備試劑：DNA 模板、10×ROX（根據(jù)機(jī)型決定，具體見使用方法）。
乳酸桿菌屬通用染料法熒光定量PCR試劑盒使用方法
一、稀釋 PCR 陽性對(duì)照（以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個(gè) 10 倍稀釋度為例）
1. 注意：由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行，千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分）。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原，本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照，只提供可以直接使用的 DNA 片段作為陽性對(duì)照。
2. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管，分別為 7，6，5，4，3，2。
3. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液（*好用帶芯槍頭，下同）。
4. 在 7 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對(duì)照，充分震蕩 1 分鐘，得1×10E7 拷貝/μL 的陽性對(duì)照。放冰上待用。
5. 換槍頭，在 6 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得)，充分震蕩 1 分鐘，得 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對(duì)照。放冰上待用。
6. 換槍頭，在 5 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對(duì)照到 5 號(hào)管中，充分震蕩 1 分鐘，得 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對(duì)照。放冰上待用。
7. 重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的陽性對(duì)照。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備
8. 如果有N個(gè)樣品，必須設(shè)置N+2個(gè)提取，多出的一個(gè)是PC（樣品制備陽性對(duì)照），一個(gè)是NC（樣品制備陰性對(duì)照）。可以用 10μL上步制備的PCR 陽性對(duì)照的第4號(hào)（濃度為 1×10E4 拷貝/μL，10μL相當(dāng)于1萬拷貝）或第5號(hào)（濃度為1×10E5拷貝/μL，10μL 相當(dāng)于10萬拷貝）再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣，以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品，則PC和NC的體積也必須是200μL。
9. 用自選方法純化樣品的DNA，本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的一管式病毒DNAout 或其升級(jí)版柱式病毒DNAout。本試劑盒免費(fèi)贈(zèng)送15次一管式病毒DNAout。
三、設(shè)置qPCR反應(yīng)（20μL體系，在樣品制備室進(jìn)行）
10. 如果只做1次重復(fù)，則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管，其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)
樣品，1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照，6個(gè)用于PCR陽性對(duì)照。如果做2-3次重復(fù)，則反應(yīng)設(shè)置數(shù)量相應(yīng)增加2或3倍。
11. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分（本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對(duì)照，并且陽性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲(chǔ)存好后*后加）：
|
成分 |
樣品管 N+2 個(gè) |
PCR 陰性 對(duì)照管 |
PCR 陽性 對(duì)照管（2-7 管） |
|
2×qPCR MagicMix （棕色管） |
10 μL |
10 μL |
各 10 μL |
|
乳酸桿菌屬通用 PCR 引物混合液（白蓋） |
2 μL |
2 μL |
各2 μL |
|
自備 10×ROX (見注) |
2 μL |
2 μL |
2 μL |
|
N+2 待測(cè)樣品 DNA 模板 |
6 μL |
不加 |
不加 |
|
第 7 步所得 PCR 陽性對(duì)照稀釋液（2-7 號(hào)） |
不加 |
不加 |
各 6μL（2 號(hào)樣到 2 號(hào)管，3 號(hào)樣到 3 號(hào)管…） |
注:僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對(duì)照，其他熒光PCR儀器（如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480）不需要使用 ROX，則用水替代。
12. 蓋上蓋子后上機(jī)，按下面參數(shù)進(jìn)行PCR（具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化）。
|
過程 |
溫度 |
時(shí)間 |
|
預(yù)變性 |
92℃ |
5 分鐘 |
|
PCR 反應(yīng)（35 個(gè)循環(huán)） |
94℃ |
60 秒 |
|
50℃ |
60 秒 |
|
|
72℃ |
60 秒 |
13. 數(shù)據(jù)采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進(jìn)行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合 DNA 時(shí)，*大吸收光譜在 471 nm，結(jié)合 DNA 時(shí)的*大吸收光譜在 500 nm，*大發(fā)射光譜在 530 nm。信號(hào)采集可以設(shè)置在復(fù)性或延伸步驟。
四、數(shù)據(jù)處理
14. 如果把本試劑盒用于定量檢測(cè)，則以陽性對(duì)照濃度的 log 值為橫軸，以 Ct 值為縱軸，繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 DNA 濃度的log 值，再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測(cè)，只判斷陽性或陰性，則陰性對(duì)照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長，有典型擴(kuò)增曲線，Ct 值應(yīng)該小于或等于30。對(duì)待測(cè)樣品，如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性，如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間，則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的 Ct 值如果大于或等于 40 則為陰性，如果小于 40，則為陽性。
五、熒光定量PCR技術(shù)的基礎(chǔ)理論：
1、熒光定量PCR線性關(guān)系成立的條件分析 、熒光定量PCR線性關(guān)系成立的條件分析。
左圖橫坐標(biāo)是PCR循環(huán)次數(shù)，縱坐標(biāo)是總的熒光強(qiáng)度Rn,改圖反映的是各個(gè)樣品隨著 左圖橫坐標(biāo)是PCR循環(huán)次數(shù)，縱坐標(biāo)是總的熒光強(qiáng)度Rn,改圖反映的是各個(gè)樣品隨著 每輪PCR反應(yīng)，其總的熒光量的實(shí)時(shí)變化；右圖橫坐標(biāo)也是PCR循環(huán)次數(shù)，縱坐標(biāo)是 每輪PCR反應(yīng)，其總的熒光量的實(shí)時(shí)變化；右圖橫坐標(biāo)也是PCR循環(huán)次數(shù)，縱坐標(biāo)是 總的熒光強(qiáng)度與熒光本底的差值RT RB即△Rn的對(duì)數(shù)，在右圖中確定閾值線，該直 總的熒光強(qiáng)度與熒光本底的差值RT –RB即△Rn的對(duì)數(shù)，在右圖中確定閾值線，該直 線上所有樣品的RT RB的對(duì)數(shù)都相同，熒光定量PCR的線性關(guān)系才會(huì)成立。 線上所有樣品的RT –RB的對(duì)數(shù)都相同，熒光定量PCR的線性關(guān)系才會(huì)成立。
