**印跡的基本原理、實(shí)驗(yàn)步驟
**印跡的基本原理、實(shí)驗(yàn)步驟
Western Blot原理
Western Blot(**印跡)采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,被檢測(cè)物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。SDS-PAGE可對(duì)蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行分離,轉(zhuǎn)移到固相載體——例如硝酸纖維素薄膜(NC)上。固相載體可以吸附蛋白質(zhì),并保持電泳分離的多肽類(lèi)型及其生物學(xué)活性不變。轉(zhuǎn)移后的NC膜就稱(chēng)為一個(gè)印跡(blot),用蛋白溶液(如5%BSA或脫脂奶粉溶液)處理,封閉NC膜上的疏水結(jié)合位點(diǎn)。用目標(biāo)蛋白的抗體(一抗)處理NC膜——只有待研究的蛋白質(zhì)才能與一抗特異結(jié)合形成抗原抗體復(fù)合物,這樣清洗除去未結(jié)合的一抗后,只有在目標(biāo)蛋白的位置上結(jié)合著一抗。用一抗處理過(guò)的NC膜再用標(biāo)記的二抗處理,二抗是指一抗的抗體,如一抗是從鼠中獲得的,則二抗就是抗鼠IgG的抗體。處理后,帶有標(biāo)記的二抗與一抗結(jié)合形成抗體復(fù)合物可以指示一抗的位置,即是待研究的蛋白質(zhì)的位置。
(一) 配膠
1.將玻璃板洗凈,*后用ddH2O沖洗,將與膠接觸的一面向下傾斜置于干凈的紙巾晾干。
(四) 轉(zhuǎn)膜
電泳結(jié)束前20分鐘左右戴上手套開(kāi)始準(zhǔn)備
5、 在暗室中,將 1×顯影液(50ml)和定影液(50ml)分別到入塑料盒中;在紅燈下取出 X-光片,用切紙刀剪裁適當(dāng)大小(比膜的長(zhǎng)和寬均需大 25px);打開(kāi) X-光片夾,將膜放入X-光片夾,并將發(fā)光液均勻涂抹在膜上,之后把 X-光片放在膜上,一旦放上,便不能移動(dòng),關(guān)上 X-光片夾,開(kāi)始計(jì)時(shí);根據(jù)信號(hào)的強(qiáng)弱適當(dāng)調(diào)整曝光時(shí)間,一般為 1min 或 5min,也可選擇不同時(shí)間多次壓片,以達(dá)*佳效果;曝光完成后,打開(kāi) X-光片夾,取出 X-光片,迅速浸入顯影液中顯影,待出現(xiàn)明顯條帶后,即刻終止顯影。顯影時(shí)間一般為 1~2min(20~25℃),溫度過(guò)低時(shí)(低于 16℃)需適當(dāng)延長(zhǎng)顯影時(shí)間;顯影結(jié)束后,馬上把 X-光片浸入定影液中,定影時(shí)間一般為 5~10min,以膠片透明為止;用自來(lái)水沖去殘留的定影液后,室溫下晾干。
(六) 注意事項(xiàng)
1.顯影和定影需移動(dòng)膠片時(shí),盡量拿膠片一角,手指甲不要?jiǎng)潅z片,否則會(huì)對(duì)結(jié)果產(chǎn)生影響。
2.一抗,二抗的孵育時(shí)間因抗體不同可做適當(dāng)?shù)恼{(diào)整。
Western Blot實(shí)驗(yàn)試劑及儀器
1.試劑準(zhǔn)備
(1)甲醇
(2)轉(zhuǎn)移緩沖液(Tris5.8g 甘氨酸2.9g SDS 0.37g 甲醇200ml V=1L)
(3)一抗,二抗
(4)PBST,PBS,Tween-20
(5)顯影液(5X):
自來(lái)水(加熱至 50℃) 375ml (以下藥品加到溫水中)
米吐?tīng)?1.55g, 亞硫酸鈉(無(wú)水) 22.5g, 碳酸鈉(無(wú)水) 33.75g, 溴化鉀 20.95g,補(bǔ)水至 500ml
(6)定影液:
自來(lái)水(50~60℃) 700ml (以下藥品按順序加入前者溶解后再加后者)
硫代硫酸鈉 240g, 亞硫酸鈉(無(wú)水) 15g, 冰乙酸 12.6ml,硼酸 7.5g,鉀明礬 15g(水溫冷至 30℃以下時(shí)再加入),加水定容至 1000ml,室溫保存
2. 材料準(zhǔn)備
轉(zhuǎn)膜用的夾子,兩塊海綿墊,一支滴管,兩張濾紙,一張PVDF膜,轉(zhuǎn)膜槽,轉(zhuǎn)移電泳儀,搖床,計(jì)時(shí)器,磁力攪拌器,轉(zhuǎn)子,Western blot 盒,一塊SDS-PAGE膠,脫脂奶粉
實(shí)驗(yàn)步驟
2.分離膠及濃縮膠均可事先配好(除AP及TEMED外),過(guò)濾后作為儲(chǔ)存液避光存放于4℃,可至少存放1個(gè)月,臨用前取出室溫平衡(否則凝膠過(guò)程產(chǎn)生的熱量會(huì)使低溫時(shí)溶解于儲(chǔ)存液中的氣體析出而導(dǎo)致氣泡),加入10%AP及TEMED即可。
3.封膠:灌入2/3的分離膠后應(yīng)立即封膠,膠濃度<10%時(shí)可用0.1%的SDS封,濃度>10%時(shí)用異丁醇或異戊醇,也可以用0.1%的SDS,封膠后靜置至膠凝固。待膠凝后將封膠液倒掉,如用醇封膠需用大量清水及ddH2O沖洗干凈,然后加少量0.1%的SDS,目的是通過(guò)降低張力**殘留水滴。
4.灌好濃縮膠后1h拔除梳子,注意在拔除梳子時(shí)防止氣泡進(jìn)入梳孔使梳孔變形。撥出梳子后用ddH2O沖洗膠孔兩遍以去除殘膠,隨后用0.1%的SDS封膠。若上樣孔有變形,可用適當(dāng)粗細(xì)的針頭撥正。30min后上樣,長(zhǎng)時(shí)間有利于膠結(jié)構(gòu)的形成,因?yàn)槿庋塾^的膠凝時(shí)其內(nèi)部分子的排列尚未完成。(10%的AP*好現(xiàn)配現(xiàn)用,如在4℃存放勿超過(guò)兩周。30%的丙烯酰胺如有沉淀,*好棄掉)
(二) 樣品處理
培養(yǎng)的細(xì)胞(定性)
1.去培養(yǎng)液后用溫的PBS沖洗2~3遍(冷的PBS有可能使細(xì)胞脫落)。
2.對(duì)于6孔板來(lái)說(shuō)每孔加200~300uL,60~80℃的1×loading buffer。
3.刮下的細(xì)胞在EP管中煮沸10min,期間vortex 2~3次。
4.用干凈的針尖挑絲,將團(tuán)塊棄掉,如果沒(méi)有團(tuán)塊但有拉絲現(xiàn)象,可將EP管置于0℃后在14000~16000g離心2min,再次挑絲。若無(wú)團(tuán)塊也無(wú)絲狀物但溶液有些粘稠,可使用1ml注射器反復(fù)抽吸來(lái)降低溶液粘滯度,便于上樣。
5.待樣品恢復(fù)到室溫后上樣。
培養(yǎng)的細(xì)胞(定量)
1.去培養(yǎng)液后用溫的PBS沖洗2~3遍(冷的PBS有可能使細(xì)胞脫落)。
2.加入適量的冰預(yù)冷的裂解液后置于冰上10~20min。
3.刮下的細(xì)胞收集在EP管后超聲(100~200w)3s,2次。
4.12000g離心,4℃,2min。
5.取少量上清進(jìn)行定量。
6.將所有蛋白樣品調(diào)至等濃度,充分混合沉淀后加loading buffer后直接上樣*好,剩余溶液(溶于1×loading buffer)可以低溫儲(chǔ)存,-70℃一個(gè)月,-20℃一周,4℃ 1~2天,每次上樣前98℃,3min。
3. 組織
1.心肝脾腎等組織可每50~100mg加1ml裂解液,肺100~200mg加1ml裂解液??墒謩?dòng)或電動(dòng)勻漿。注意盡量保持低溫,快速勻漿。
2.12000g離心,4℃,2min。
3.取少量上清進(jìn)行定量。
4.將所有蛋白樣品調(diào)至等濃度,充分混合沉淀加loading buffer后直接上樣*好,低溫儲(chǔ)存剩余溶液(溶于1×loading buffer),每次上樣前98℃,3min。
(三) SDS-PAGE電泳(不用染色)
使待測(cè)樣品中的蛋白質(zhì)按分子量大小在凝膠中分成帶。關(guān)于SDS-PAGE實(shí)驗(yàn)操作原理及FAQ參考
1、準(zhǔn)備:轉(zhuǎn)移緩沖液(Tris5.8g 甘氨酸2.9g SDS 0.37g 甲醇200ml V=1L)、轉(zhuǎn)膜用的夾子、兩塊海綿墊、一支滴管、2張濾紙、一張PVDF膜。
2、剪切濾紙和膜時(shí)一定要戴一次性PE手套,避免手上的蛋白污染膜。轉(zhuǎn)膜前,PVDF膜應(yīng)在甲醇溶液中浸泡5-10秒,浸濕為止,在平衡液中平衡(甲醇的作用是固定大分子蛋白,使小分子物質(zhì)易轉(zhuǎn)移出去)
3、將轉(zhuǎn)膜用的夾子、兩塊海綿墊、一支滴管、2張濾紙、一張PVDF膜浸泡在轉(zhuǎn)移緩沖液中,然后取出SDS-PAGE膠,將濃縮膠輕輕刮去,并在膠的一角做一缺角作為標(biāo)記以區(qū)分上樣順序。將膠在轉(zhuǎn)膜緩沖液中浸泡5min左右,以平衡離子強(qiáng)度。
4、夾子打開(kāi)平放底部黑色電極(陰極),放一張海綿墊片,用玻棒來(lái)回?fù){幾遍以搟走里面的氣泡。在海綿墊片上放置1張轉(zhuǎn)移緩沖液浸泡過(guò)的濾紙,對(duì)齊,然后用一玻璃棒作滾筒以擠出所有氣泡,必要時(shí)可滴加轉(zhuǎn)膜液潤(rùn)濕。取出浸在轉(zhuǎn)膜液中的凝膠平放在濾紙上,排除所有氣泡。將PVDF膜置于聚丙烯酰胺凝膠上,玻棒來(lái)回?fù){幾遍排除所有氣泡,注意在膜的正面作上標(biāo)記(可以將膜的一角剪去或用簽字筆在膜的邊角上做記號(hào))。在膜上蓋一張轉(zhuǎn)移緩沖液浸泡過(guò)的濾紙,同樣須確保不留氣泡。*后蓋上另一張海綿墊,蓋上陽(yáng)極板(白色),夾緊。保證對(duì)凝膠有一定壓力。
5、將夾子放入轉(zhuǎn)移槽中,要使夾的黑面對(duì)槽的黑面,夾的白面對(duì)槽的紅面。轉(zhuǎn)膜時(shí)將轉(zhuǎn)移槽放入冰水中進(jìn)行。轉(zhuǎn)膜過(guò)程中電轉(zhuǎn)液用磁力攪拌器攪拌。一般用恒壓110V轉(zhuǎn)移60min。對(duì)于大分子量的蛋白(超過(guò)120KD),時(shí)間約80min。特別要注意加強(qiáng)降溫措施。
(五) **學(xué)檢測(cè)
1、 取膜,將膜正面朝上在1xPBST溶液中搖動(dòng)五分鐘,洗一次,移至含有封閉液(含10%脫脂奶粉的 瓶PBST 緩沖液;脫脂奶粉5g,PBST 100ml,溶解后 4℃保存。使用時(shí),恢復(fù)室溫,用量以蓋過(guò)膜面即可,一次性使用。)的平皿中,室溫下脫色搖床上搖動(dòng)封閉1小時(shí)。注:10%脫脂牛奶的作用:用大分子物質(zhì)封閉非相關(guān)的蛋白結(jié)合位點(diǎn),降低非特異性結(jié)合(抗體與膜),同時(shí)也使背景色不高。PBST:T為吐溫,減少非特異性吸附,不影響抗體抗原的結(jié)合。
2、 取出膜在1xPBST溶液中洗5分鐘,搖動(dòng),洗兩次,放入1xPBST緩沖液中(內(nèi)含5%脫脂牛奶),同時(shí)加入一抗與二抗到緩沖液中,孵育60min。
3、 用1xPBST洗至少三次,5min/次
4、 化學(xué)發(fā)光,顯影。顯影液與水1:4,定影液與水1:9,發(fā)光液
注:顯影液(5X):
自來(lái)水(加熱至 50℃) 375ml (以下藥品加到溫水中)
米吐?tīng)?1.55g
亞硫酸鈉(無(wú)水) 22.5g
碳酸鈉(無(wú)水) 33.75g
溴化鉀 20.95g
補(bǔ)水至 500ml
配制時(shí),上述藥品應(yīng)逐一加入,待一種試劑溶解后,再加入后一種試劑。4℃保存。使用時(shí)用自來(lái)水稀釋至 1 倍。
定影液:
自來(lái)水(50~60℃) 700ml (以下藥品按順序加入前者溶解后再加后者)
硫代硫酸鈉 240g
亞硫酸鈉(無(wú)水) 15g
冰乙酸 12.6ml
硼酸 7.5g
鉀明礬 15g(水溫冷至 30℃以下時(shí)再加入)
加水定容至 1000ml,室溫保存
發(fā)光液:魯米諾試劑2ml、過(guò)氧化氫1.3ml
3.轉(zhuǎn)膜時(shí)濾紙與膠,膠與膜,膜與濾紙之間不能有氣泡,必須用玻棒搟走。有氣泡會(huì)影響轉(zhuǎn)膜效果。
4.把 X-光片放在膜上,一旦放上,便不能移動(dòng)